<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 786 bps / non-identical: 0 bps

Full alignment

AC011293.5	1	GAATTCATTCGAATAGAATTGAATCGAAAGGAATGCAGTAGTATTTAATG	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01065750.1	3750	GAATTCATTCGAATAGAATTGAATCGAAAGGAATGCAGTAGTATTTAATG	3799

AC011293.5	51	GAATTGAATAGAATGGAATCGCATGGAATGGACCACAATGGAATGGACTG	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01065750.1	3800	GAATTGAATAGAATGGAATCGCATGGAATGGACCACAATGGAATGGACTG	3849

AC011293.5	101	GAATAGAGCAGACTCGAATATAATGGATGGAATGTAAAGCAAAGGAATGC	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01065750.1	3850	GAATAGAGCAGACTCGAATATAATGGATGGAATGTAAAGCAAAGGAATGC	3899

AC011293.5	151	AATCAAATGGAATGGAATGGAAACCAATGGAAGGCAGTAGAATGCAATGC	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01065750.1	3900	AATCAAATGGAATGGAATGGAAACCAATGGAAGGCAGTAGAATGCAATGC	3949

AC011293.5	201	AATGGAATGGAGGGGAATCATGTGGAATGGAATCGAAAGGGATGGAATTG	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01065750.1	3950	AATGGAATGGAGGGGAATCATGTGGAATGGAATCGAAAGGGATGGAATTG	3999

AC011293.5	251	AATGGAATGGACTTGAATGGAATGTACTCGAATGGAATGGACTGAAACAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01065750.1	4000	AATGGAATGGACTTGAATGGAATGTACTCGAATGGAATGGACTGAAACAA	4049

AC011293.5	301	AAAGGTTTTGAACGGATTGGATTCAAACGGAATGGAATGGAGTGGAATGG	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01065750.1	4050	AAAGGTTTTGAACGGATTGGATTCAAACGGAATGGAATGGAGTGGAATGG	4099

AC011293.5	351	ATTGGAATGGAATAGAGTGGAATGGTGTCAAATGGAATGGAACCGAATGG	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01065750.1	4100	ATTGGAATGGAATAGAGTGGAATGGTGTCAAATGGAATGGAACCGAATGG	4149

AC011293.5	401	AATGCAATCGATGGAATGGAATTGATGGAATCGAAAGGAATAGAGTAGAA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01065750.1	4150	AATGCAATCGATGGAATGGAATTGATGGAATCGAAAGGAATAGAGTAGAA	4199

AC011293.5	451	TGGATTGCAAAAGAAAGTTATTGAACAGAATGGAATTGAATGGAATGGAC	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01065750.1	4200	TGGATTGCAAAAGAAAGTTATTGAACAGAATGGAATTGAATGGAATGGAC	4249

AC011293.5	501	TGGAATGGACTCAAATGGAATGAACGGGAGTGGAATGGACTTGAATGGAA	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01065750.1	4250	TGGAATGGACTCAAATGGAATGAACGGGAGTGGAATGGACTTGAATGGAA	4299

AC011293.5	551	TGGGCTGGAGTGGAATGCACTCTAATGAAATTGAAACGAATGGAAAGGAA	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01065750.1	4300	TGGGCTGGAGTGGAATGCACTCTAATGAAATTGAAACGAATGGAAAGGAA	4349

AC011293.5	601	TAGACTGGAATGGAATGGGATGGAAGGGAATTAATGGAATGAAATGGAAT	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01065750.1	4350	TAGACTGGAATGGAATGGGATGGAAGGGAATTAATGGAATGAAATGGAAT	4399

AC011293.5	651	GTAATGGAATGGAATGGAATGGAATTTAACGGAATGGAATGGAGTCGAAT	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01065750.1	4400	GTAATGGAATGGAATGGAATGGAATTTAACGGAATGGAATGGAGTCGAAT	4449

AC011293.5	701	GGAAGAAAATCAAATGGAATGACATCGAATGGAATGGAATGGAATTGACT	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01065750.1	4450	GGAAGAAAATCAAATGGAATGACATCGAATGGAATGGAATGGAATTGACT	4499

AC011293.5	751	CGAATGGAACGGACTTGAAACGAATAGAAATGAAAG	786
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01065750.1	4500	CGAATGGAACGGACTTGAAACGAATAGAAATGAAAG	4535

Overview

Query
AC011293.5 - 159722 bps
Hit
ABBA01065750.1 - 4535 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 786 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

Short-link