<=>End overlap alignment

Alignment #1 HSP: 2729 bps / non-identical: 150 bps

Full alignment

AL837517.14	1	GAATTCGTCTCATAGAGTTGAACCTTTCTTTTCATTGATCAGTTTGGAAA	50
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01015878.1	61885	GAATTCGTCTCATAGAGTTGAACCTTTCTTTTCATTGATCAGTTTGGAAA	61934

AL837517.14	51	CACTCTTTTTGTAACATCTGCAGGTGGATGTTTGGAGCACTTTGTGGCGA	100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01015878.1	61935	CACTCTTTTTGTAACATCTGCAGGTGGATGTTTGGAGCACTTTGTGGCGA	61984

AL837517.14	101	ATGGTGTACAAGGAAATATCTTTACATAAAAAGTACGCAGAAGCATTCTG	150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01015878.1	61985	ATGGTGTACAAGGAAATATCTTTACATAAAAAGTACGCAGAAGCATTCTG	62034

AL837517.14	151	AGACACCACTTTGAGATGTGTGCATTCAAGTCACCGGGTTGAGCCTATCT	200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01015878.1	62035	AGACACCACTTTGAGATGTGTGCATTCAAGTCACCGGGTTGAGCCTATCT	62084

AL837517.14	201	TTTTATAGAGCAGTTTTGAAACTCTATCTTTGCAGATTCTGTAAGTGGAT	250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01015878.1	62085	TTTTATAGAGCAGTTTTGAAACTCTATCTTTGCAGATTCTGTAAGTGGAT	62134

AL837517.14	251	ATTTGGTGTGTTGTGCAGCCAAGTGTGAAAAAGGAAATATCTTCACATAA	300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01015878.1	62135	ATTTGGTGTGTTGTGCAGCCAAGTGTGAAAAAGGAAATATCTTCACATAA	62184

AL837517.14	301	AAACCACACAAAATAATTCTGAGAAACTTCTTTGTGTTGTGTGCATTAAT	350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01015878.1	62185	AAACCACACAAAATAATTCTGAGAAACTTCTTTGTGTTGTGTGCATTAAT	62234

AL837517.14	351	CTCACAAAGCTGAACCTTTCTTTTGATTAAGCAGTTTTGAAACACTCGTT	400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01015878.1	62235	CTCACAAAGCTGAACCTTTCTTTTGATTAAGCAGTTTTGAAACACTCGTT	62284

AL837517.14	401	TTGTAGAATGTGCAAGTCAATGTTTCGAGCACTTTGAGGCCTATTGTGGA	450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01015878.1	62285	TTGTAGAATGTGCAAGTCAATGTTTCGAGCACTTTGAGGCCTATTGTGGA	62334

AL837517.14	451	AAAGGAAATATCTTTACATAAAAACTGCAAAGAAGCATTGTGAGAAACTA	500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01015878.1	62335	AAAGGAAATATCTTTACATAAAAACTGCAAAGAAGCATTGTGAGAAACTA	62384

AL837517.14	501	CTTTGTGACGTGTGCATTCATCACACAGAGTTGAACCTTTCTTTTTATTG	550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01015878.1	62385	CTTTGTGACGTGTGCATTCATCACACAGAGTTGAACCTTTCTTTTTATTG	62434

AL837517.14	551	AGCAGTTTGGTAACACTCTTTTTGTATAATCTCCAAGGGGATATTTTTAG	600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01015878.1	62435	AGCAGTTTGGTAACACTCTTTTTGTATAATCTCCAAGGGGATATTTTTAG	62484

AL837517.14	601	CGCTTTGAGATCTTTGGTGGGAAAGGAAATATCTTCACATAGAAACTACA	650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01015878.1	62485	CGCTTTGAGATCTTTGGTGGGAAAGGAAATATCTTCACATAGAAACTACA	62534

AL837517.14	651	CAGAAGCATTCTGAGAAACTTATTTGGGATGTGTGCATTCATCTCACCGA	700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01015878.1	62535	CAGAAGCATTCTGAGAAACTTATTTGGGATGTGTGCATTCATCTCACCGA	62584

AL837517.14	701	GTTGAATCTATCCTATGATTGAGCAGTTTTTAATCACTCTTTTTGTAGAA	750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01015878.1	62585	GTTGAATCTATCCTATGATTGAGCAGTTTTTAATCACTCTTTTTGTAGAA	62634

AL837517.14	751	TCTGCAAGTGGATATTTGGAGCACATTTAGACCTATGGTGGAAAAGGAAA	800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01015878.1	62635	TCTGCAAGTGGATATTTGGAGCACATTTAGACCTATGGTGGAAAAGGAAA	62684

AL837517.14	801	CATCCTCACATAAAAACTACAAAGAAGCATTCTGAGAAACTTCTTTTTGA	850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01015878.1	62685	CATCCTCACATAAAAACTACAAAGAAGCATTCTGAGAAACTTCTTTTTGA	62734

AL837517.14	851	TGTGTGCACTCATCTCACAGAGTTGAACCTTTATTTTGATTGAGCAGTTT	900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01015878.1	62735	TGTGTGCACTCATCTCACAGAGTTGAACCTTTATTTTGATTGAGCAGTTT	62784

AL837517.14	901	GGAAACACTCTTTTTGCAGAATTTGGACGTGTATATTTGGAGTGCTTTGT	950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01015878.1	62785	GGAAACACTCTTTTTGCAGAATTTGGACGTGTATATTTGGAGTGCTTTGT	62834

AL837517.14	951	GGCCTGTTGTGGAAAAGAAAATATCTTCACATAAAAACTACACAGAAGCA	1000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01015878.1	62835	GGCCTGTTGTGGAAAAGAAAATATCTTCACATAAAAACTACACAGAAGCA	62884

AL837517.14	1001	TTCTGAGAAACTTCTTTGTGATGTGTGTATTCATCTCAGAGGGTTGATCC	1050
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01015878.1	62885	TTCTGAGAAACTTCTTTGTGATGTGTGTATTCATCTCAGAGGGTTGATCC	62934

AL837517.14	1051	TTTCTTTTGATTGACCAGTTTGGACACACTCATTGTAGAATCTGCAAGTG	1100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01015878.1	62935	TTTCTTTTGATTGACCAGTTTGGACACACTCATTGTAGAATCTGCAAGTG	62984

AL837517.14	1101	GATACTTGGAGCGCTTTGAGGCCTATGGTGGAAAAGGAAATATCTTCACA	1150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01015878.1	62985	GATACTTGGAGCGCTTTGAGGCCTATGGTGGAAAAGGAAATATCTTCACA	63034

AL837517.14	1151	TAAAAACTACACAGAAGCATTCTCAGAAACTTTTTTGTGATGTCTGCATT	1200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01015878.1	63035	TAAAAACTACACAGAAGCATTCTCAGAAACTTTTTTGTGATGTCTGCATT	63084

AL837517.14	1201	CGACTCACACAGCTGAACCTATCTTTTGATTGAGAAGTTTTGATTCTCTC	1250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01015878.1	63085	CGACTCACACAGCTGAACCTATCTTTTGATTGAGAAGTTTTGATTCTCTC	63134

AL837517.14	1251	TTTTTGTAAAATCTGCAAGTGGATATTTGCAGACCTTTCTGGCCTATTTT	1300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01015878.1	63135	TTTTTGTAAAATCTGCAAGTGGATATTTGCAGACCTTTCTGGCCTATTTT	63184

AL837517.14	1301	GGAAAAGGAAATATCTTCACATAAAAAAATAGAAGCATTCTGAGAAACTT	1350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01015878.1	63185	GGAAAAGGAAATATCTTCACATAAAAAAATAGAAGCATTCTGAGAAACTT	63234

AL837517.14	1351	CTTTGTGATGTGTGCGTTCATCTCAAAAAGTTGAACATTTCTTTTGATTG	1400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01015878.1	63235	CTTTGTGATGTGTGCGTTCATCTCAAAAAGTTGAACATTTCTTTTGATTG	63284

AL837517.14	1401	AGAAGTTATTATTATTATTATACTTTCAGTTTTAGGGTACATATGCACAT	1450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01015878.1	63285	AGAAGTTATTATTATTATTATACTTTCAGTTTTAGGGTACATATGCACAT	63334

AL837517.14	1451	TGTGCAGGTTAGTTACATATGTATACATGTGCCATGCTGGTGCGCTGCAC	1500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01015878.1	63335	TGTGCAGGTTAGTTACATATGTATACATGTGCCATGCTGGTGCGCTGCAC	63384

AL837517.14	1501	CCACTAACTCGTCATCTAGCATTAGGTATATATCCCAATGCTATCCCTCC	1550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01015878.1	63385	CCACTAACTCGTCATCTAGCATTAGGTATATATCCCAATGCTATCCCTCC	63434

AL837517.14	1551	CCCCTCCTCCCATCCCACAACAGTCCCCAGAGTGTGATGTTCCCCTTCCT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
ABBA01015878.1	63435	CCCCTCCTCCCATCCCACAACAGTCCCCAGAGTGTTATGTTCCCCTTCCT	63484

AL837517.14	1601	GTGTCCATGAGATCTCATTGTTCAATTCCCACCTATGAGTGAGAATATGC	1650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01015878.1	63485	GTGTCCATGAGATCTCATTGTTCAATTCCCACCTATGAGTGAGAATATGC	63534

AL837517.14	1651	GGTGTTTGGTTTTTTGTTCTTGTGATAGTTTACTGAGAATGATGACTTCC	1700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01015878.1	63535	GGTGTTTGGTTTTTTGTTCTTGTGATAGTTTACTGAGAATGATGACTTCC	63584

AL837517.14	1701	AATTTCATCCATGTCCTTAAAAAGGTTATGAACTCATCATTTTTTATGGC	1750
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01015878.1	63585	AATTTCATCCATGTCCTTAAAAAGGTTATGAACTCATCATTTTTTATGGC	63634

AL837517.14	1751	TGCATAGTATTCCATAGTGTATATAGACTGGATTAAGAAGATTTAGTAGT	1800
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01015878.1	63635	TGCATAGTATTCCATAGTGTATATAGACTGGATTAAGAAGATTTAGTAGT	63684

AL837517.14	1801	TTTTAAAAAAACTTTTTGTAATATCTGCAAGGGGATATTTAGAGCGTTTT	1850
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01015878.1	63685	TTTTAAAAAAACTTTTTGTAATATCTGCAAGGGGATATTTAGAGCGTTTT	63734

AL837517.14	1851	GGGGCCTATTGTGGAAATGGAACTATCTTCATATAAAAACTAGACAGAAG	1900
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01015878.1	63735	GGGGCCTATTGTGGAAATGGAACTATCTTCATATAAAAACTAGACAGAAG	63784

AL837517.14	1901	CATTCTGAGAAACTTTTGGTGATCTGTGCATTCAACTCACAGCTTTGAAC	1950
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01015878.1	63785	CATTCTGAGAAACTTTTGGTGATCTGTGCATTCAACTCACAGCTTTGAAC	63834

AL837517.14	1951	CTTTCTTTTGATTGAAGAGTTTTGAAACACTCTTTTTGTAGTATCTGTAA	2000
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01015878.1	63835	CTTTCTTTTGATTGAAGAGTTTTGAAACACTCTTTTTGTAGTATCTGTAA	63884

AL837517.14	2001	ATGGATATTTGAAGCGGTTTGAGGTCTATCTTGGAAAAGGAAATATCTTC	2050
			||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01015878.1	63885	ATGGATATTTGAAGCAGTTTGAGGTCTATCTTGGAAAAGGAAATATCTTC	63934

AL837517.14	2051	ACATATAAACTAGACAGAAGCATTCTGAGAAACTTCTCTGTGATAAGTGC	2100
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01015878.1	63935	ACATATAAACTAGACAGAAGCATTCTGAGAAACTTCTCTGTGATAAGTGC	63984

AL837517.14	2101	CTTCACCTCACAGAGTTGAACCTTTCTTTTGATTGAGCAGTTTTGAAACA	2150
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01015878.1	63985	CTTCACCTCACAGAGTTGAACCTTTCTTTTGATTGAGCAGTTTTGAAACA	64034

AL837517.14	2151	CTCTTTTTGTTGTATATGCAAGTGGATATTTGGAGCGATTTGTGGTCTAT	2200
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01015878.1	64035	CTCTTTTTGTTGTATATGCAAGTGGATATTTGGAGCGATTTGTGGTCTAT	64084

AL837517.14	2201	GGTGGAAAAGGAAATATCTTCACGTAAAAACTAGACAGAAGCACTCTGAG	2250
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01015878.1	64085	GGTGGAAAAGGAAATATCTTCACGTAAAAACTAGACAGAAGCACTCTGAG	64134

AL837517.14	2251	AAACTTCTTTGTGATGTGTGCATTCATCTCACCAAGCGGAACCATTCTTT	2300
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01015878.1	64135	AAACTTCTTTGTGATGTGTGCATTCATCTCACCAAGCGGAACCATTCTTT	64184

AL837517.14	2301	TGATGGAGCTGTTTTGAAATACTCTTTTTGTAGAATCTGCAAGTGAATAT	2350
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01015878.1	64185	TGATGGAGCTGTTTTGAAATACTCTTTTTGTAGAATCTGCAAGTGAATAT	64234

AL837517.14	2351	TTGGAGTGCTTTCAGGCCTGTGGTGGAAAAGGAAATATCTTCACATAAAA	2400
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01015878.1	64235	TTGGAGTGCTTTCAGGCCTGTGGTGGAAAAGGAAATATCTTCACATAAAA	64284

AL837517.14	2401	ACTAGACAGAAGCATTCGGAGAAACTTCTTTTTAGTGTGTGCATTCATCT	2450
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01015878.1	64285	ACTAGACAGAAGCATTCGGAGAAACTTCTTTTTAGTGTGTGCATTCATCT	64334

AL837517.14	2451	CACAGTGTTGAAACTTTCTTTTGATTGAGGGTTTTGAAACAGTCTTTTTG	2500
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01015878.1	64335	CACAGTGTTGAAACTTTCTTTTGATTGAGGGTTTTGAAACAGTCTTTTTG	64384

AL837517.14	2501	ATAAATCTGCAAGTGGATATTTGGAGCGAATTGTGGCCTATGGTTTAAAA	2550
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01015878.1	64385	ATAAATCTGCAAGTGGATATTTGGAGCGAATTGTGGCCTATGGTTTAAAA	64434

AL837517.14	2551	GGAAATATCTTCACATAAAAGCTAGACAGAAGCTTTCTGAGAAACTTCTT	2600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01015878.1	64435	GGAAATATCTTCACATAAAAGCTAGACAGAAGCTTTCTGAGAAACTTCTT	64484

AL837517.14	2601	TGTGATATGTGCGTTCATCTCACCGGGTTGAATCTTTCCTTTCATCGAGC	2650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
ABBA01015878.1	64485	TGTGATATGTGCGTTCATCTCACCGGGTTGAATCTTTTCTTTCATCGAGC	64534

AL837517.14	2651	AATATTGAAACACCCTTTTTTTTGAATCTGAAATAGATATTTGGAGCGAT	2700
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01015878.1	64535	AATATTGAAACACCCTTTTTTTTGAATCTGAAATAGATATTTGGAGCGAT	64584

AL837517.14	2701	TGTGTCCTATGGTAGTAAAGGCAATATTT	2729
			|||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01015878.1	64585	TGTGTCCTATGGTAGTAAAGGCAATATTT	64613

Compact alignment

skip 1550 bps 100% identity alignment

AL837517.14	1551	CCCCTCCTCCCATCCCACAACAGTCCCCAGAGTGTGATGTTCCCCTTCCT	1600
			||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
ABBA01015878.1	63435	CCCCTCCTCCCATCCCACAACAGTCCCCAGAGTGTTATGTTCCCCTTCCT	63484

skip 400 bps 100% identity alignment

AL837517.14	2001	ATGGATATTTGAAGCGGTTTGAGGTCTATCTTGGAAAAGGAAATATCTTC	2050
			||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
ABBA01015878.1	63885	ATGGATATTTGAAGCAGTTTGAGGTCTATCTTGGAAAAGGAAATATCTTC	63934

skip 550 bps 100% identity alignment

AL837517.14	2601	TGTGATATGTGCGTTCATCTCACCGGGTTGAATCTTTCCTTTCATCGAGC	2650
			||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
ABBA01015878.1	64485	TGTGATATGTGCGTTCATCTCACCGGGTTGAATCTTTTCTTTCATCGAGC	64534

skip 79 bps 100% identity alignment

Overview

Query
AL837517.14 - 90085 bps
Hit
ABBA01015878.1 - 64613 bps
Total alignments
1
Best alignment
alignment #1 (HSP: 2729 bps)
Best alignment cartoon

Alternate alignments

#%IDscoreHSPstartendstrandhstarthendhstrand
199.89010272912729161885646131
Short-link