High Throughput Gene Targeting: Create Design

This custom vector design tool is provided by the EUCOMM consortium as a service to the research community. When using this tool, the user agrees not to submit more than five designs per day for creation without prior discussion with the High Throughput Gene Targeting Group at the Sanger Institute.

Design Type Oligo Select Method Artificial Intron Design
5' retrieval block size U block size Min 5' spacer Critical Exon Min 3' spacer D block size 3' retrieval block size
 
       
Subtype Domain Disrupted
Gene Build Gene
Start Exon End Exon
Target Start Target End
Primer Length Design Comment
Created by
Valid After Annotation
not done
oligos on fwd strand oligos as ordered View gene and design in Ensembl UCSC BLAT recombineering primers
Design ID: 44949
Chr: 16
Strand: 1
Status: Ordered
BACs: RP23-350J14 : RP23-203N5 : RP23-236B11 : RP23-413L6 : RP23-10I3 : RP23-69B8 : RP23-236E11 : bMQ335k13 : RP24-358E16 : RP24-95A14 : RP24-95A23 :
Instance: Plate 56: Well H08: BACs RP23-350J14 RP24-95A14 RP24-358E16 RP24-95A23
Instance: Plate 213: Well B07: BACs RP23-350J14 RP24-95A14 RP24-358E16 RP24-95A23
Oligos on GRCm38:
Type Start End Length Seq
G5 87351443 87351492 50 TCTTGGAAATATAGTATTACTGCACCAAACCAGAAAATCAAGTGTTGGTG
U5 87356390 87356439 50 AGCTGTAGCCTCCCGTTCACTCCTTCGTGCTGTGTGATTTTAGAAGCAAC
U3 87356497 87356546 50 AAAATAGGTGCAAAGTTGAATGTCCTTGCAGAGAACTTGAGAATACAAAA
D5 87357388 87357437 50 CCAAGTGCTGGGATTAAAGGCGTGCGCCATCATGCCCGGCTTTCTTTACT
D3 87357453 87357502 50 TAATTACATAGTTTCCCCCTTCCCTTTCCTTCCTCCAGATCCTCCCATAT
G3 87361751 87361800 50 TGTGATTTCTTTTTTCTCCCTTTGTTCTATAGAAACCTGTGCCCACTTTA
Oligos:
Type Start End Length Seq
D5_D3 87246634 87246648 15 TTTAAGATTATAATA
G5 87240639 87240688 50 TCTTGGAAATATAGTATTACTGCACCAAACCAGAAAATCAAGTGTTGGTG
U5 87245586 87245635 50 AGCTGTAGCCTCCCGTTCACTCCTTCGTGCTGTGTGATTTTAGAAGCAAC
U3 87245693 87245742 50 AAAATAGGTGCAAAGTTGAATGTCCTTGCAGAGAACTTGAGAATACAAAA
D5 87246584 87246633 50 CCAAGTGCTGGGATTAAAGGCGTGCGCCATCATGCCCGGCTTTCTTTACT
D3 87246649 87246698 50 TAATTACATAGTTTCCCCCTTCCCTTTCCTTCCTCCAGATCCTCCCATAT
G3 87250947 87250996 50 TGTGATTTCTTTTTTCTCCCTTTGTTCTATAGAAACCTGTGCCCACTTTA
G5_U5 87240639 87245635 4997 TCTTGGAAATATAGTATTACTGCACCAAACCAGAAAATCAAGTGTTGGTGGTAGTTCTGCACTCATGAAACCCATTTTTAGTTAGTTTAATCTAAAAGGAATTCATTACAGGATAGCCAAGGGGTAAGACAGCCAACTTTGAGAGGTTCAAAGATCAGCTTTGGAGTGAGCTTCCAAAAGTACCTCTTACAACTACACAACTGAGCTTCTGGCCCATTCATGGTGGTCAGAAAGCCACGGAATCAAGAATCCACTACCAAATGTGGACCCTGTGGACATAGATGGGCGTTGGAGAGAGTCCCAAAGCAACCAGAGCAGTCACCAGAGTGACTGAGCCCATCAGCATCAAATCCATCAGAAGTCTGAGCCCCGCCCCCAACTCTCAGACTAGAAGGATGAGTACAAGCACTGGGCCAGGGAATAGGAAACTATACTGAGTAGCTTGAAAGGCAGGTCAAGACTCCCTCTCCCAAAATCCTAAAAGCTGTGCAGGGATGTAGCTCAGTGCTACCGTGCTTACCTAGCATGCACAAGGTCCTGAGTTTGATCCCCAGCACCAAATCAACAGGGTATGGTGGGATAAACCTAGAGTCCCAATGTAGAGCAGGGGAAGGCAGGAGAAGCAGAAGCTCAAGCTTCTAAGCAACACAGCAAGCTCGAGGCCAGTCTGGGCTACTGAGACCCTCTCTCAAAAATAATAAGTAAAAAATAAATAAAAATAGGGGCCAGGCTGGGCTACTGAGACCCTCTCTCAAAAATAATAAGTAAAAAAATAAATAAATAAAAATAGGGGCCAGGCTGGGAATATAGTTTGGGGGTAAAATGTGTACATATCATGTCTGAAAACCTAGGCTCAATGCCCAGGATCAAAAACAAACAAACAAACAAACAAACAAAAGAGTGCAGCCATTCATGGTGGCTCATGCCCTTAATCACAGCACTTGGGAGGCAGAAGGTAGAAGCTAGGGGGGTCTCTGTGATTTAGTCAGACCAGCCAAGGCTATACAATGATACCCTGTCATCCCTCCCCTGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGGGGGGACAATTAAGCATGAAAGTACATACAAGTCACAAAGGAAGAAATTCCCTAGATGGACATATGAACCCAGGCTTAACCTCAATCAGCAATCGGACCAAATCAATCTAAAACAAATCTCTAATATTAGATCAACTCATAAATCTGCCACCAAAAGATGTTAGGAGTATACACAAGTATGGTTAGTTTGGAGAGTGATGGGGCACTATCCAGAGAAACTGAACCGTATGTCCACTAACAGATCTCCCACCAGGAACTGTGTGTACAGCAGTGGGAGAACACTAAGGATGTCAGTCTCAAGAATTGCAACAGACAAACCTGGAGCAAAGTCAACCTTCACATACATAAAAACAAATCCTCTGGGAAACAACTGAGAAAGAACGGCTATTTCATTTCATTGCTTGTATGCCAAAGACATTTTAAGGATGCATGTGAAAATAACAAATTCTCGCGGCACATGACACTCTAAAAAAATATTTCCGTATTATATTTAGATGTTTGTGCATGTGTGCACATGTATGCTGCCATACCCTTGGAGGTCTGAGAACTCTAAGAATAGGTTTTCTCCTTCCACTGTGTGAGTCTCAGGGACCTGCTCCATGTGCTCAGGTTTGGCAGCACCTACCTGCCTTTTACCAGCAGAGCTTTCTTGCCATTTTCAAGTCTGTATTTGTGATGCCGCCAGAGAACAGAAGATTTAACTCCCAGGAACTGGAGTTACTCTGTTTGTGAACCACCTGCTGTGGGTACTGGGGACCAAATTCTAGTCCTCAATAATAGCCTTATTCCAGAACCATCTCTCCAGCCCCTTACATTTTTTTAAAGACTATGATTTTCTGTATGTTATTTTTTTGCCTGTATGTATGGGCACAACAGTGACACTGACGCAGGAAGAGCAACAACCTGGAGCTGGGGTTATAGGGAGTTGTGAGCCACCAAACAAAGGTGCAGGAAACCAAACTTTTGTCTTCTTCAAGTGCAGTACAAGGTCTCAACCCCTGAGCACTTCCCCAGCCCTCCAAACCATTGTCTCTGTTTTGTTTCATTGTTTTTCGGAGACTGGATTTCTTTATGTAGCCCTGGCTGTCCTGGAACTCTCTTTGTAGAACAAGCAGAGATCTGCCTGCCTCGGTCTCCAGAGTGCTGGGATTAAAGGCAAGAGCCACCACAGCCCAGCCCAAACTATAATTTCAATGAATGAAAGTGTTATCCATGTATAATATTGTCAAATACAAAATAAAAATTAAAAGTCATAAAAGCTGGGCATGGTGCCACAGCTTTTATAGTCCCAGCACTCAGGAGACAGAGGCAGGTGGAGGATCACTATGAGTTCCTGGCCAGACTGGCCTACATAGTAAATTCCAAGACAGTGAGAATCTGTATAACAAAATTAAGCAAATAAAAGTAGTCATAATCTTATAGATGGGTATTTACATTTCAGTTGCTTAAAAAACAATAAATTTTGTAAACACTATTTTTGCAAGTGCTTACAAGTTTAAAAGGGAAGAAACTTTCCAAATGTCATTAGAATAAAGCAGTCACCTTAGTACAAAATAACTGACGATGCTCAATATTAGGGTAGCCGATAAAAGTAAGCACAAGTTGAAAACGGATGTTAGAGGTTGCTTAAAAGTTCCAGAGAGCCCAACAAGCTCTTTCACCCCAAACGCCACCCAGTGTAAGACAAAAGCGCATGCGCAGCAAGCCTGACGCGTGCGTACTCAACGCCCGCCCATAGGAAGCGGAAGGGAAAAGATGGCGGCGCCGAGTGTCCCCACGCCGTTGTACGGGCACGTGGGTCGCGGAGCCTTCCGCGACGTGTACGAGCCAGCGGAGGACACGTTCCTGTTACTGGACGCGCTCGAGGCGGCGGCGGCCGAGCTAGCAGGGTGCGAGGAGGGTGCGCGCCTCAGGGGGAGAGAACGGGGTGGCCGGGAGGCGGAAGCCGGAACTTGCCGCCCTCCTCCGGAAGTGGTGGGCCGGCCTACTTTCTGGTGATTGACAGCAGAGAGGGGTAAAGGAGGCGTGTCCGGCGGGCTGGGGTTAGAGCATCGCTCAGATGTTCCTGCGGCTTCAAGGTCACCCTGCCCTGCCTTTTAGCTGTTAATCTGAAGAATGTAAACGCGCCTCTGAGGAGCAGCCGGAGTTTAGCAACCAGAAGCAAGATGTCCCAAAACTTTCCTAATTTTCTATTTTAATTTTTTTAAGTGAATATGTAAAACTCGCCTTAGTGCAAGAATAACATCCTCTAGCAAAGGAAGAACACATAAGGATCAGTGAACTATTAAATTCACTCAACCTAGTCAAGGAACAACCACTAGCCGTCTGAGCACTTAAAGTGTTATTGCAACTGGGATTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTAATTGAACTGTTAGAATTTTAGTTGCATGTGGTTAGAACTATTAGGGAAGGTTTAAATAGTCACGTGCCTCCGCCGGTAGGATTTTCACTAGCCTGATTTGTTGAAGGATTGGCCATAGCTTTAATTGACATAAATAGTAAATGCCCACATGTTAACTTTTCTGAGAAAAGAATTTGAGCTGAGAACGGGAAAGATGGCTCAGCTGGTAAAGGCACTCGCTGTCAAGCCTGCAGACCTGAGTTCCGGCCTCAGAAACTACTACAGGTTGTTCTTGGAGGTTCAGTTACAATGCTGAGGACCATTCTGCACACATACATATAATCACTCTAATAAAATAGTTTGCCGAAAGAATATGGGTCATTAACTTAATGGCCAAGATTCCTACTGGGTGTCTCCAGAACGAAATAGCCATCATGTTTATTTATATTGTCACTTTTTTTCTGCCTATAAAACCAGTCTTTCTTCATAGATGGTGGAGCATTTTGAGCTACTGGAATATCTCGTGGAGCACTGAATTGTAACTTGAATGCTCAAAACAGCTCAGAAAAATTTACAGCTACAAATTGCATTGCTTCGTATGCTGTAATAGAGCTGACCTTGTTACAAAGGCTAGGAATTCTAGTTATTTTTGAGACCGTAATGATTATTTCCATAAAGAAGGCACCTGGTAAGATTCACAGACTTTACTATGACCCACTAGTGGCTTGCGTGTCCTGTTATGTGGGTCACATAGATATGTGGCTGATTCTAAAGGTAAAAAGGAAATACTGTAACTTCTTCTTGAGTTGTTTGAACAGTTAAGTGACAGAAAAATCTTGTAAATGTCATCAGGCCAATCAGTCATGGAAATTAAGTAGTGCTTTTGACACACTGATAGTGATCAAAGGAAATACATTTATTGGAAAGTTATATAAGATTTTTAAATTTAGAAAGCTAAGATTATTGGCATTCTAAGATCAGACACTGAAGTACTTGCCCAACACAGTACTCTCGTAGGGAGAGAGGTCTTTGTTATTCATGTATCTAGGTAGATGGAAGGCTTTTAGCAAACCCTAGGATATGCTGCTGGGTTTATTTAAGTACTTCAATTTAAATACTGTACACACCTAAACTATTAGCATGCTTGAGCTATGAAATAATAAGCACTAAGTAGTTGCCAGAAATGGTAAATCCCTTTTATTCCCACATATTTGCAAGTGAGTGATGGTGCTGGGGAAATACATTATATGGCATGAGAGTTGTCTTCCATGAAGAATTATCTTCATAAGAAGGAACTAAATACTTTGTTTTTGTTGTTAGAGTGGAAATATGCCTTGAAGTAGGAGCAGGATCTGGTGTGGTGTCTGCATTCCTGGCCTCCATGATAGGTCCTCGGGCCTTATACATGTGAGTATGTGATGTTCCTCCACCCCTCCTGGGTCTCTGTGACTGCAGCAGCTCAAGTGGAACATTTTAAATAGACAATACGTCTCTGATAGTGAGGACTCAAGTCACAGCTTATGCTGGCCCCCAGCTGTAGCCTCCCGTTCACTCCTTCGTGCTGTGTGATTTTAGAAGCAAC
U3_D5 87245693 87246633 941 AAAATAGGTGCAAAGTTGAATGTCCTTGCAGAGAACTTGAGAATACAAAAGCCAGGAGGAAACAGCAGAAGATTTTACCATACGTGGGACAAATGTGTTTCTTGCAGCTCGTTACCGCCTATGTCGTTTGTGTGGCAGTGTCCGGGCAGCGATCTCTTTCCCTTTTCATTTGCTGGCCGTTTCAGATGAGTGTGGGCAGATTTTTCAGCAATGCTTGCCTTTGTTATAACAAGCCTTTGCTTGCTTTTTCTTTGCCATTATGAAAACATTCTGGATTTTTTTTTCCCAACACCATGTTCGAGTTAAGAAAGCATTCCTAACTTTACCCCAGCAGGAGTCTGCTGGTACACTGTCTGCTTCCAGACATCCTCCTGATCTTTCCCTCTGTCTCGCGTTGATAGGTGCACTGATATCAACCCTGAGGCAGCCGCATGTACCTTGGAAACAGCACGCTGTAACAGAGTCCATGTTCAGCCAGTGATCACAGATTTGGTGAGCATTAATCCTCGTTCAGTAGTGATCGATTTCGATTCATTGATGGTCAGTCACTTTTAGTGGAAATACACTTAAGGAATTAGTTTTGTTTTGTTTTGTTTGTATGAGACAAAGTGGCATGTAGCCCAGGCTAGCCTCAAACTTCCTATACAGACACAGATGACCTTGAACTCTTTTTTTTTTTTTAATTTTTAATTAAAATTTTTCTCTTTTACTTTTTTCTTTGGTTTTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTTGTTGTTTTTTGTTTTGTTTTGTTTTTTGGTTTTTGTTTTTTGGTTTTTTGAGACAGGGTTTCTCTGTGTAGCCCTGGCTGTCCTGGAACTCACTCTGTAGACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAAACCCGCCTGCCTCTGCCTCCCAAGTGCTGGGATTAAAGGCGTGCGCCATCATGCCCGGCTTTCTTTACT
D3_G3 87246649 87250996 4348 TAATTACATAGTTTCCCCCTTCCCTTTCCTTCCTCCAGATCCTCCCATATACCCCTGCTTGCTCTCTTTCAAATTCCTGGTCTCTTTTCTTCATTAATTGTTGTTACATACTTAAGTACACACGCACACACACACACACACACACACACACACACACACACACGCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTACATATATTCCTAAATAGAACCTGCTCAGTCTGTATGAATGCTTTCAAATCTGGCCATTTGATATTAGGTAAATGCTGGAGTTACCGGTTGACCATAAGCATGACTACATGTGACTGTATTCAGTTCAAACTGGCTTAAGCCTAAAACACATAATGCACAGCTAGCACAGAAACTCAGATGACATCACACATTTTCTTCTTAGCTCTGAGTTTCCCTCTGGGGTCCCTCTGGCATCTCATAATAACAAGATGTTTGCATCTCTGTGTATAATTTTTAGCAAGTCCCCATGAAGAAGTTTATTCTTGGGATGAGAGTTGTTTGGAACCACATGGGTCGTGTGTTCCGGGAATTTGAAGAGTGACTTTGACCTGGGTCACAGTAGATCCTACCCAAGCTTGAGAGTGAGAGGAGACACAGTGTCCCTGTCTACGGTACTTTTCTATTGTAGTGAGGAAGTGGAGGGTTTGCAGGATGAAGGAAGGAGAGACGGGAAGTAGGGACAGGGCAGGACACAACTGGGCCCGGCCTTGGCTTTTGAAACCTCAAGATCTGAAAAACCACCTCCAGGCAAGGCATACGAGTGTGTGGCGCCATTCCCATTCAGACCACACCAGTCCCATCAAAAGCCGAGGAGACATAAGCAGAAACAAGGGAGCACGGATCCTGGGGACAAGCAAAATGATTGACAGGTTATTCATTTCTTTCTTTAGACAGTTCTCTCTGTGTCCTGGTTTGTCTTTGAACTTTCTATGTAGTTGTAGATAACTTCAATTCTATCTTCTCCTGCCTCTACCTCTTTAGAGGACGACTACACCCCTACTCAATTGCCTTATTTTTTTTTATAATTTTTTTAAAAAGTTTTAAGACTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGCCTGTGTGTATGTCTCTGCACCACATTTCTCCAGTGCCCACCAAGGCCAGAAGAGGGTATTGGATCCCTTGGGACTAGAGTTACACATGGTTGTTAGCCACAATGTGGGTACTGGGAATTGAACCTTTGTCCTCTGCAAGAGCAGCCAGTGCTCTGAACTGCTGAGCCATCTCTCCAGCCCTTCATTGTTTTGTTTTAAGAAATTCGGATTAGACCTTTTAAGTCTCAAGTATCTTTTAAGTTGTTAAGACATTCCAAGGGTACTAGTAGGACTTGAATAGTCTTAGCTTTGCGGGATACCTTGTGTCTCAACAGTGAAATGCTGTTCATAAGGAAAGGCATAATAGCAGGCTAGGTAGACACGAGAAACACTGCTCTCCATGCTAATTTTCTGGGGTGGAGGTGGGGGATATAAAAGTCTCACAAAGTCCAGGGTAGCCTTGAACTCTCTTTTGGTTAAGGATGACTTTGAACTACAGATCCTGCCTTCATCTCCCAAGTTCTGGGGCTCCTAACGTGCCACGCTATCATGCCACGCTATCATGCCACGCTATCTGTGCTTCTAGACCAGTAGTGTTCTTACCCTGACCAGGGCAGGCAGCTTCCCTACTCTTTCACATTTACAAAGGATTTTGCATCTTAGGACTAAGCCCAAGAGACAAGAAATTGTATTCACAGTGCTAAGAAGTAGAGTGTCAAGAAGGTTCTCAGGCCACTCACATACGTGGCCATGCATAGCGATGCACGTGATGTAGAACTGCCTGCTGTGTCTGTAAAGAATATTACATCTATTTTTTGATGGAACAATAAAACCACATAAAATAGAACAAACCCAAACTGAAGTAGATCCAGAAACTCCAGTGTTAATAAAACGATCTCGAGGATTATAGCCTGGGTCTCCTGTCTAGCTCCAGAAGCTACACAGTGGCTCAGGGATGTGACTGGAGAGTCTACATGCTAGACTTAACTCCTCAGTAGTTAAAGGTGGCCCTGAAAGACTGGCGTGGTGGCACACGCCTTTAATCCCAGCACTCGAGAGGCAGACGCAGGCAGATTTCTGAGTTCAAGGCCAGCCTGGTCTACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGGACTATACAGAGAAACCCTGTCTCGAAAAACAAAAAAACAAAAACAAAAACAAAAAGGTGGCCCTGAACTAAACTGATTTGACAAAGCAAGAAACAAGAGACAGGCTTAGCAGAGCAGTCGATTTACAAACTCTTATACATTCAAACTCCAGGGATTATTACAGCTATCATAGAAAATAAACCCATTGCTTAGCTGAGATTACATGTCTAAAAAGTAGCAACCAGCAGGGTATATTGGCTCAGTCCTGTAATCTCGGTACTCAGGAGTGTAAGATAGATTACAGCTGGCCTGGGCTACATAGTGTGACTGCTTCCTCAAAATCAAAAAGGTAGAATTGTCATCGTTCTTCGTTTTCAGTCTTACAATACAGTCTTTTAAAGTACCTACTACATGTTCCATTACATCATCAAAACATACCACACACGTTTTACCATTTACAAACTCACTGGCATCAGCTACTCTGAGGTATGTGGTACTCAGGCCAGTTCAGGTGTCTGCTCTGTGAAGAAGCTGACAGCCCTCCTCCGTCTTCTCACTCTTGCCCCGTTTCTCCGTCATCTATTGGCAGAATATCTTTTCTCCCTGTTGCTGTGCTTCATGCAAGAAAACCAGACAGTTCTGGCCCGTATTTAACATAAGAGCCCTCCATGGTGGCCCCAGTGGGAATAAAGTCCGTGTGTTTTGGCTGCATGCATGCAGGGCCTCTTTCACTTATTTTTCAGTTCTTGGAAATGCTAAGGCAGAGAGCTGTCTAGACCTGGCTAGAGATGCCTGTACTAGACAGTCAGTCCTCGGTTACATTTTATTTAAGTCTTTTGATGTTAGAATTTTTGTTTTAATATTTTGTCCTTTTGCTTTTTGTAAAATCCATCCCATGGTTATTACTGTATAGCTGGATAGGACAAAGGACTATGAGTTACAAAGCAAAATCTTGTCTAGTTTCTTTATCCAGCGTTTCTAGAAAATTCTTATTTCCGACTTCTTTTAAGAAACTTTTTCTTTATGGAATTGAAAACACTTTCAAAGCTTGCACTTGCATGCACATGTGCGCGTGCATGACCATGCACACACACACACACACACACACACACACCAGTGAATCCCTCATTCTTGCACTGGTGAAGGAAAAAACTAATCTTCTTTTGGTTTGCAGGCCAAGTTATATCATTCATATATATATATATATATATATATATATATATATATATTTTTAAGGAGTAATTATTGTTTCCCTTTTAAAGGAGCAGAAAGGGGGCTGGATGGATGGTTCAGCAGTTAGGACCACTGGCTGCTCTTTCAGAGGTCCTGAGTTCAATTCCTAGCAACCACATGTTGTCTCACAACCATGGATAATGGAATCTGATTCTATCTTCTGGCCTTCAGGCATTCATGCAGCCAGAGCCCTCGTATACTTAAAATGATTACTATTTTTTTTTTAATTAGAGAAGAAAAAAATACTTCTATAAGCATATCCTCAAAAATAGGTCTTAAGAATTCTCTTTGAATTGTAAGTTAACAGGCATGTCAGGATAATTAAAATGGAATTGATTATAGAAATCTAAGTTGGGAAATTCTCTGATATCACTTCATAATGTATATTCAGTGTTCATAACCCAGCCCAATACATATCAACTGCTTGGATGGTGTGAATGGAAATGAAGTGACTTTATTCATAGTTTTTTTTTTTAATTTAATTTTATTTTTATTAGGTATTTTCCTCGTTTACATTTTCAATGCTATCCCAAAAGTCCGCCATACCCCCCCCCGAATCCACTACCCACCCACTCCCCCGTTTTGGCCCTGGGGTTCCCCTGTACTGGGGCATATAAAGTTTGCAAGTCCAATGGGCCTCTCTTTGCAGTGATGGCCGACTAGGCCATCTTTTGGTACATATGCAGCTAGAGTCAAGAGCTCCGGGGTATTGGTTAGTTCATAATGTTGTTCCACCTATAGGGTTGCAGTTCCCTTTAGCTCCTTGAGTAATTTCTCTAGCTCCTCCATTGGGGGCCGTGTGACCCATCCAATAGCTGACTGTGAGCATCCACTTCTGTGTTTGCTAGGCCCCGGCTATTCATAGTTTTAACACACACACAATTGTGATTTCTTTTTTCTCCCTTTGTTCTATAGAAACCTGTGCCCACTTTA
U5_15 87230587 87245635 15049 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Comments:
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creating candidate regions
attempting to insert candidate regions into db
done inserting candidate regions
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finished running aos
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AOS Produced 14 oligo candidates altogether
inserted results of aos runs
Aligned target to NCBIM36 assembly: chr: chromosome:NCBIM36:16:1:98252459:1, start 87246093: end 87246184
Found best 129-bac on NCBIM36: bMQ335k13
Found 3 RP24 black6 bacs on NCBIM36
Entered all non-repetitive oligos
Sequence count unchanged by blasting
finished aligning oligos to bac
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DESIGN COMPLETE
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D-type: D1
Creating display features: mapping to reference assembly
Created display features
Inserted sequence arms between oligos

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