High Throughput Gene Targeting: Create Design

This custom vector design tool is provided by the EUCOMM consortium as a service to the research community. When using this tool, the user agrees not to submit more than five designs per day for creation without prior discussion with the High Throughput Gene Targeting Group at the Sanger Institute.

Design Type Oligo Select Method Artificial Intron Design
 
       
Gene Build Gene
Start Exon End Exon
Target Start Target End
Primer Length Design Comment
Created by mp7
Valid After Annotation
not done
Comment Type Comment Detail Edited User Edited Date
oligos on fwd strand oligos as ordered View gene and design in Ensembl UCSC BLAT recombineering primers
Design ID: 254099
Chr: 7
Strand: 1
Status: Ordered
BACs: RP24-76O20 : RP24-143K5 : RP24-264F23 : RP24-320B2 : RP24-62I5 : RP24-360A12 : RP24-72K12 : RP24-266M8 : RP24-535K10 : RP24-322L19 : RP23-308C20 : RP23-192F24 : RP23-308A22 : RP23-413J11 : RP23-65I3 : RP23-215J14 : RP23-215J16 : RP23-215L16 : RP23-49A1 : RP23-245N17 :
Instance: Plate 192: Well A10: BACs RP23-308C20 RP23-192F24 RP23-413J11 RP23-308A22
Oligos on GRCm38:
Type Start End Length Seq
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Oligos:
Type Start End Length Seq
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Comments:
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creating candidate regions
attempting to insert candidate regions into db
done inserting candidate regions
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finished running aos
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AOS Produced 14 oligo candidates altogether
inserted results of aos runs
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Found 10 RP24 black6 bacs on NCBIM36
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Created display features
Inserted short and long range genomic sequence arms

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