High Throughput Gene Targeting: Create Design

This custom vector design tool is provided by the EUCOMM consortium as a service to the research community. When using this tool, the user agrees not to submit more than five designs per day for creation without prior discussion with the High Throughput Gene Targeting Group at the Sanger Institute.

Design Type Oligo Select Method Artificial Intron Design
 
       
Gene Build Gene
Start Exon End Exon
Target Start Target End
Primer Length Design Comment
Created by am9
Valid After Annotation
not done
Comment Type Comment Detail Edited User Edited Date
oligos on fwd strand oligos as ordered View gene and design in Ensembl UCSC BLAT recombineering primers
Design ID: 232225
Chr: 8
Strand: 1
Status: Ordered
BACs: RP24-181I24 : RP24-347M22 : RP24-199A14 : RP24-74B12 : RP24-134B6 : RP24-125L12 :
Instance: Plate 170: Well B01: BACs RP24-199A14 RP24-181I24 RP24-74B12 RP24-347M22
Oligos on GRCm38:
Type Start End Length Seq
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G3 129141744 129141793 50 CCGTCTGGCCCTGGGCTTTTTTTGGCTGGGAGACTATAACTGGTTCTATT
Oligos:
Type Start End Length Seq
U5_D3 131656309 131662476 6168 TCAATAACATTAGATTTCTAAAGAAAGAAAGTGATATGGACAGATTAGAAACCTCTTTAACTGATATAATTGACACAACTTGGTGATTGAAGGCAAAGAAAAGGTAATGAGGTACTCATGTTACTTTCAACCAATAGAAATGAACAGAAGAGGAAAAACAAGTAGTGGAAGGGTGTGGCACAGTTGCAGAGCACCTGCCTATCCACCAAGATCTTGGTTTGATCCCTGGTGTCGCACAAGAGATAGGAAAAGCATGTTTTACAGAGAAAATGATGCATCTGTAAGTGGCTATTATCCATATTCATTCAGACACCACAGCCTAAGTGCATGATTCCAAGGGTTTGATATTAGAGGCTGTTGTTCTTTCTTTCCTTTGGGTGAATCATTAAAGTTAATAATATAGACTATGAGCCCAATTAGTGTGTAGAATTGTATATAAAATATATAATAGTGGATACTTGTATCTATTTCAGAGTTCATAACATCCCATTCAGCTTTAGAATCTCAAACTGAAACTGAAAGTCAGCCAGGTAAGCAGCCATTCATTTAAATATCATCACATTAACACCTCCTAAAGGTTCCATAACCTTCCCTATTACTTCCTTGGTCCTGCTGAGGACCAAGTGTTCATGTTACTGAGCCTGTGGGAACATTCTCATTCATACCAAAATAGTTAAGAAACTTGCATTCTTGATGCTTTTTTTCAAGATTTTGTCTGTTTGTTGGTTTGTTTGTTTTTAAGAAAAAGTGTCAGGTGTCCCAAGTTGACTTCAAACAACAGCTTACTTTCTGCAGTCTATACTAGTGATGACTGCATGAGTTTTCATATGCAGTACACAAGCACCTGCATGGGGACCTATTGTGGTTTTTGGTAGCAAAGGTTGTTTGGATTCGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATTTCTCACTCAAGGGAAGCTGTAGCAGGGAGATAGGTGTTGGTGACAAATATAGCTTGCAATGTGATCATATGACAGTAGCACCAGCACTGAAGCATGTTATCTATGAGATGTACATAGATTTGGGTTCTGTACCACAGGTACTTATGGGCTAGCTGGGTCTGTGAGATCCAGATGCTGCTTAATTCTGAGGTACTACTTTCTCAGCAAACTCAGTGGGGATGTTCCTGCAGCATCTGAAACTCTAGTGTCTGCATTGCAAGTTCTGTCAGACTGGCCCCAAAGCTGGGCTCTTGCACACATGCAGCAGAAGTTGCATCAGATCCTTGGGCTGCAAACTGTGACCTGGTAGCAGCTTTTATGTTTGAGACCTGGGCACTCAAAGTGGCATTGAAGCTTGGGTTGCAGTGTTGTGAGCACACAGTGCAACTCTGAGAGTCTGGGGACTTCTTAGATGCAGGGATGGCTTTCCTGGCTGCCTGTATGGGATGGAGAGAAATATGGTATGATTTTTATCTATTTTCTCTATATAAGTCCCTTGACTTCTTTATATTTCTCTCTTCATCTTTGATTTTTATAGAGCTTTAATAGTATTACATGTTTAGGTGCATATATTTTATTTTGTTTTTAATTTATGTTTTTAAGCTTTGAAACAGCCAGATAGATCACTAGGTAAAAGTACTTACTACACAGGCTTGGTGGTCTGAGTTAGTCCTTGGAACTTGTATGATAGTGAGAGGAGGAAATCAGATTCCATAAAGCTGTGTTTAAGTCTCCACAAGCAGGCTCTGTTATAATCACCCCCACATAAATATGCATACCCATACAATGATAACAAAAGTTTTAAATGATACATGCCTTAGTATCTGTCATTAATTTTAGAAAATCTGTAATCATCACTTCACTTTGCTCTTTCATTTTCCCTATGTCACTCATTACCCAGTTAAGCATGTATTTCACCTGTTTTATTACATAATTAGGCATGTATTACACCTGTTTTTTTAACCCCATTTAGGTATGTATTACACCTGTTTTTATTACTCCATTAGGCATACATTACACCTGTTTTTGGTTTTTTTAACCATTTCACAGATCTTGAATGCTCAATTACATTTTTACCTCATTTGCTTCTCAGTTTTGGGAGTTTCTGATGACAGTTTCATGCTCACTGACTTTTTTCAAGCAAGTTGCTTTATTGGTCTGCAAAATACTCTTAAGAATTATTTAAAAATATGCAGGTTGTTTTCCAAAGAGTTCTGAGTATTAAATCATGTTTTTAAATCCTTACATTAGCCATATACAATAGACATTTATTAGACATCAATGTAACATTACCTGGTTATTATGATTATTAAAATAGCCATTCCTGGTCCAGAAGATCAAAACCAGCACGATCTCCATGACACAGGGCAACAACAAAACATCCAAGAGGAATCCCTGTGGGAATTCCGTATTGATAGTGTAGCAGAAGCCATGAGCCTTGAAACAGACCAATGACTTACTGCAATGAACATTTGCAAATAAAGATGAATGGATAAATGGATATAGTGTGTGATACACTGTGACACACTTCAACTCCCACAACAAGATGATTTTTTGTTTGTTTTCATTTTCATTCTATCTTATTATTTTGTTTTGGGGAGGTTGCTAGGGTGGAGGTGTGGGTGAGATGAGTAGGGTTAGGGTACATATTGTGAAATTCACAAAGAATCAATAAAAAGTTAAAAAAAAACCGAGAGATCCCACATAGATTAGAACAAATGGTGTGATTGGCACAATGCAAGTGCTCCTAAAGGAGTAACAGAGATGGTTCTATATTTTCTCTTTTCTTTTTTTTTCCAAGACAGGGTTTATTTTGTATATCTGTGCAGTAACTAGCTCTGTAGAAAGGCTGGACTCAAATTCTCAGAGAGTTTGCCTAGCTCTGCAATTGGTAGGATTAAAGGTGTTTGCCAACACTGTCCTATTTCTTATTTAATTATTTATTTATTTACTTGTTTTACTTATTTATTTTAAAATGGTGACATTTTTTCTTTTCTTCGTTTTTTTTTTTTAAGATTTACTTATTTATTTTTTTATATATGTGAGTACACTTGCTCTCTTCAGACATACTAGAAGAGGGCATCAGATCCCATTGCAGATGGTTGTAAGCCACCATGTGGTTGTTAGGAATTGAACTCAGGACCTCCAGAAGAGCAGTCAGTGCTCTTTACTTCTAAGCCATCTCTCCAGCTCCCATTTATATTTTTTTAAGATTTACCTATTCATGTATTTTTATGTATATATGTATATGAGTGTGCTGCCTTATGTGTATCAGAAGAGGGAATCTAATCCCATTACAGATGTTTCTGAGCAACCATGTGGTTGCTGAGGATTGAACTGAGAATCTGTGGAAAGCAGTCAGTGCTCTTAACCTCTGAGCCATCTCTCCATAATTTATTTGTTTTATTTTATTTTATTTTATTTACTTTTTACTTACTGCCTGTATCAGTTACAAGGCATTCTTTGCTACAATAGAGCTTTAGCAATTTTTACTTTTTTACTAGAGTTTCTGCTTATATTATCCATCTGTTCTTGTATGTTGCCAGTTTTTCCCTAGGTAATATAGGTGGAACAACATTATGAGCTAACCAGTACCCCGGAGCTCTTGACTCTAGCTGCATATATATCAAAAGATGGCCTAGTCGGCCATCACTGGAAAGAGAGGCCCATTGGACTTGCAAACTTTATATGCCCCAGTACAGGGGAATACCAGGGCCAAAAAGGGGGAGTGGGTGGGCAGGGGAGTGGGGGTGGGTGGATATGGGGGACTTTTGGTATAGCATTGGAAATGTAAATGAGTTAAATACCTAATAAAAAATGGAAAAAAAAATAAATGCTGTTAATTAATTGCTTAAAATTCCTGCCTGATAACTTAAAAATATCTACTATATCTGAAATCCTGTGCTCATAGTTGCCTATCTCTTCAGAATTTGGTTCCCCTGCCTCCTGCCCCATCCTCTGGGTATGCCTTGTATCATAGATATTTTCTTTTGAAATTTCTATTTGAAATAGAAAATTGAATTTTTCTTTTGAAAGCCAAAGATGATATATGGGAAAAAGTAAAATAAGGTAAATGTTACTGTAAGAAACATGTCACCTTCTTGTGATTATTTAGTTTTCTCATGCATATCAGTGAATTGTATGGTCATTGAACTTCAGCCATTATAACACCTTTATACATTCTATATAGGAACTCCTTCTTCAATGGCTAATCGAGTGACTATGATGATGAAAATATTTGAAAACCAGACAGCTATGTTACACAAGTAAGCTTTAGAAATATTATTTCTTATTTTCTACTTATAAAATTGAATATATAGAATAGACATATTGGGAGCATACATAAGAAATAAGGTCTTCATCATAAGCTAACCTCCTTTTACTCATTAATTAATTAATTCATTCATTCATTCATTTTATGCCCTGATCAAAGTTCTCCTTTCTCCTGTTCCCATCCCCCATTTCTCCATCCCCTTTTCCTCAAAGAAGGGGAGGCCATCCTTTGGTACCAACCCACCCTGATACATCAAGTCCCAGCAGGACTAGGTGCATCCTTTCTCATTGAGGCCAGAGAAGTCAGTCCAGCTATGGGAAAGAGACCCAAAATAGGCAACATAGTCAGAGACAGTTCCACATTCTAATTGTTAGGGGATCCACCTGAAGAACAAGCTACAAATGTATAGAGGACTCACGGGTTGATGGTTCAGTCTCTGTAAGTCTCTACAGACCCAAGTTAGTTTAGTCTGTGAGTCTTTTGTGGGGTCCTTGATCTATCAGGCTTCCTCAATCCTTCTTCCTCCATCTCTTCCACAAGACCCCCTGAGTTCCACCTACTGTTTGCCTGTGGGTCTCTGCATCTATTTTGGTCAGCTGCTAGATGGGGGCTCTCAGAAGACAGTTATGCTAGGTTCCTGCCTGCAAGTCATTATCATTAATAATGTTAGGGGTTGGATCAATGTATCAAGTTGGGCCAGTAATTAGTTGGCCATTCCCTAGATATTTGCTCCATCTTTATCCCTGCACTT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done inserting candidate regions
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DESIGN COMPLETE - All Us And Ds ACCEPTED
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