High Throughput Gene Targeting: Create Design

This custom vector design tool is provided by the EUCOMM consortium as a service to the research community. When using this tool, the user agrees not to submit more than five designs per day for creation without prior discussion with the High Throughput Gene Targeting Group at the Sanger Institute.

Design Type Oligo Select Method Artificial Intron Design
5' retrieval block size U block size Min 5' spacer Critical Exon Min 3' spacer D block size 3' retrieval block size
 
       
Subtype Domain Disrupted
Gene Build Gene
Start Exon End Exon
Target Start Target End
Primer Length Design Comment
Created by dk3
Valid After Annotation
not done
oligos on fwd strand oligos as ordered View gene and design in Ensembl UCSC BLAT recombineering primers
Design ID: 178192
Chr: 11
Strand: 1
Status: Ordered
BACs: RP24-328N5 : RP24-481G7 : RP24-289N23 : RP24-537I1 : RP24-332D2 : RP24-189D5 : RP24-471D24 : RP24-93L23 :
Instance: Plate 136: Well G02: BACs RP24-289N23 RP24-537I1 RP24-328N5 RP24-481G7
Oligos on GRCm38:
Type Start End Length Seq
G5 55486959 55487008 50 ATGTCTTCAGTGGTCTTTGGTTGGCATTTTGCTGTTAAAGAACATCTCTC
U5 55492977 55493026 50 AGCAAGGACTGAATTCTCATTGTTCTCTAGCCTCAGTTTACTTGGGGCAT
U3 55493046 55493095 50 CTTTGTAATAAACGGGGCCTCTGCACTCTTCACTCCTGTATACTTGGTTT
D5 55493643 55493692 50 CTGGATCCGTGGAGAGAGATTGGCAAGTATGTGCCAGCTAAGTCAGATGT
D3 55493831 55493880 50 AACTAGCAATATGCAACTTTTACTTATTTTATAGGAGATACTATGGAAAG
G3 55497413 55497462 50 ACTTAGACATGTTGGATAAAAAGGGGAAATGAAAAGCCAATGACAGAGCT
Oligos:
Type Start End Length Seq
D5_D3 55307195 55307332 138 GGAGACATGCCTGTAATTCCAGTGTTCCAGAGGCTGAGGCAAGGGGATTGCTGTGAGTTTGAACGTTGCCTGCATGGGCTCAGCAACAAAACTATGGTAGTTTTCTGGGAAAATATTTTAATTGTGTTATTTCTTAAT
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U5 55306479 55306528 50 AGCAAGGACTGAATTCTCATTGTTCTCTAGCCTCAGTTTACTTGGGGCAT
U3 55306548 55306597 50 CTTTGTAATAAACGGGGCCTCTGCACTCTTCACTCCTGTATACTTGGTTT
D5 55307145 55307194 50 CTGGATCCGTGGAGAGAGATTGGCAAGTATGTGCCAGCTAAGTCAGATGT
D3 55307333 55307382 50 AACTAGCAATATGCAACTTTTACTTATTTTATAGGAGATACTATGGAAAG
G3 55310915 55310964 50 ACTTAGACATGTTGGATAAAAAGGGGAAATGAAAAGCCAATGACAGAGCT
G5_U5 55300461 55306528 6068 ATGTCTTCAGTGGTCTTTGGTTGGCATTTTGCTGTTAAAGAACATCTCTCTGATGTTCTTTTAATGAAAATGGTGATTGAGTGCATAGATGAGAGAGGGCTAAAGGGATAAATATTTATACCACCTGTGCACAGGACAACTGTCCCACTGCCTTCTCAGGTGGGAAGGCACCGACTCTTCAGGTCCGTGACAGGGCAGCTGTCTGTCCTCAGTGGAAACAGGAACTTGACTTTGATTTTAAGTGCCTGACTTTGCTGACAAACTCCAAGGCCCTTCCCAACATGATCATCCTACCTACCCTGAAACTTGGAAGTCGGGACTTGAAAACCACACACATGCCTCATGCCTCATTGACTGAGACTGTCCCCACTCGGGCGTGTGCAATGGACTTGTCGTGCACAAACATAAACAGTCCCCGCTGTGAGTCTGCCAGTGAGGCGGATAGGTACCAAGCCTGAACACTAAGTACCTGCACTCCGGGTCCTTGAAGATGAGAAGTAAATTGCCTTCTCTTGTACAGATTTTATGGAAAGAACTCTTCCTATGCCCACGGGGGCTTGGATTCCAACGGGAAGCCAGCAGATGCAGTCTACGGGCAGAAGGTGGGTGCTGTGGACCAGTAGCAGCAAAGAAGGCAGCTCCCTGCCTACTGGGAAGCTGGTACCTAGGGGTGGGTTTCTGTTTAATTCTTTGGTTTGCTGAACACTCTGTGTGTTGTCAGGTTACTTTGATTCTGTGTTAGATTGCTGGCTTCAGCAGAAGAGTGCCATGTTTAAACTTAAAAGGTGTGTATTCAAGGCACTTATTTGATTATTTTATTTTATTTTATTTTATTTTATTTTATTGGTTTTTCGAGACAGGGTTTCTCTGTATAGCTCTGGCTGTCCTGGAACTCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTCAAACTCAGAAATCAGCCTGCCTCTGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAAGGCGTGTGCCCGGCTAATTATTTTATTTTTTGAGACATGATTCAAGTTTTTTGCTATTCTGGAACTTGCTATGTATGTCTGGATATTCCCCTGACTCAGTTTCTCAAGTGCTTAGATTACATATAAAAGTGGCAGGACAGTTGTTTTTAAGGCGCTAAGCTGTGATCACTGGAACTACAGCACACACCCACTGACAGCTGGACTATATTATAACAGTAATACATGTATTCTCTATATGCTGTGTTGGACATTTTTATTTTTTAAAATTTGTTTACAGATGTATTTATGTGTGTGAGTGTTTTGCTAGCATCCATGTCTGCACCATGTGTGTGCTGAGTCCCTGAGGAGGCCGGAAGAGAGCTTTGGATCCTTAGGAGCTGGATGCTGGGAACTGAGCTTAGGTCCTCTCCAGCTCTGAAGTGTTCACATATATTGGTTTGTGGGTGAGTGTGACTGAGTGGTATGCTTGTGGAGGTCAGAGGATACCTTGTCAGGAGTTCTTTGCTTCCACCGTATAGGCCCCAAAGATAACATTCTGGATTATCAGGCCCTATAGCAGGTGCCCTTACCTGCTAAGCCACCTGGGATTTATTTTTTTAACTAGATTTTTGTGTTACTTTATTGTCTCATTGTTGAGACAAATACCTGACAGAAGCAACTTAGGCAGGATGCAGGGCATTCAGGCTCACAGTCCACGTGAGAAAGGCGAGGTAGTAGGGACACAAGGTGAATGCTGGTGCTCAGGTCCCCTTTTGTACAGCACAAAGGTCTCGCCTGTGCAATGCTGCTGTCCCAGCAGAGTGTTTCCTAGGTGATTCTAGGTCTTGTCACGCTGAGTGGAGATGAGCTGGTGTGAGCGTAGCAGGTCTCTGCCCTTCAGTGTACTTGTTGTATAGCTCTTCAGATTGCTTGGAGACTGCTCAACCACTGTGCGAAGGAGCAGGAGGAAGCAGGGCTGAGTGTCAAGTACACATCTGTGAGAAAACAGGGCGGAGCTTGGAGGATCTGCCAGTCTGTTCTTGGTGCTGGCAACTGCTGTTTTAGTTTCTGAACTGGTGAGTTCCTGGGGGATTGACTCTTGCCTCCATTCCTCAGGAAATCCACAGGAAAGTGATGTCACAAAACTTCACCAACTGCCACACCAAGATCCGCCACGTGGATGCTCACGCAACTCTGAATGACGGGGTGGTGGTCCAAGTGATGGGGCTACTGTCCAACAACAACCAGGCTCTGCGGAGGTTCATGCAGACCTTTGTCCTTGCTCCTGAGGTATGTTGCTCTGTAGTGATGGAGTACTTAAAGACTAAAAGCTGTGTGGAGTCCAGATTCCTGGCAGCTCAGGGTTATAGGTATGGCTGCAGGGTAGAGCTGCTCTGTCCTCTTGTCCTAAAGCTGTGGTGCCCTCACTGTAATCTTCAGGAAGATGACTGTTGGGAGGAGCCTCCCCTAAACTGTTGAAATGCAGGAGACTTCGTGTCCCTTCGGCTGGCATCACCTAAGGACAAGGGATCTGTTTCCTAATCACCCTGTTGTCACCACATTTAGAGAACAGTGCTCGGTATATATATAGCTCATGCGGTAACCATGCCTGAGTTTCAGAAAGTAGCTGGCCTTGTCTTGCATAGTTTGTTTTTCTTGATCTGGGATTCTGTATGTAGTTCTCTGTTGTGTTTGTCTGGCCGTGTGTCTTGTTCCCTGTCATTGTAGTCCCTCCCTCCTCTGGTTTGCTTGGCATCGACAGTTCTGAAGAGCAGTCCTGTGTCATTGTCCACGCATCATATACCTTCCTCACTCATCCTTAGTGACCATGGTACTAGAAGTGTCTCTGGTTCCCCTAGGTGATATGTTCAGGTCTTGCCATTGTAAAGTCACATAGTTGTTGTATCTGGTTTATAAATTGTGACTAATCTTGGGATCCTGTATAAACGTGCTGCTCTTTATCAGTTTTGCATACCATAATTCTTTTTCATTTGAGGTTCTTGGCTGAATGGTGACAGATGGGAATGTCTGATACTATCCACCACTCTTGTGTTCATTTATTGGCATTATCTTATAAGGATCCCCTTACCCTACCATTCATTTCTAGTATATTTACTGAGTTATGATTCATTAATAATTGTTTAACATATCCTCATGTCCTGGGTCTTGTTAGTGGGAACCCTTCATGCTGGCCTGTTTTGGTGTGGGCATGGCATGCATGGTTTATGTCCTTGTGTTGACCCTGGCCCTGATCAAGCCCCACTAGCTGATGGTTCCATTCATGATGCTTGTCTGTAGTTGGGTTTCTGAAGGTACCACAGGTGGATGATGAGGGATGGCATCTGCTGTGCCTTCTCCAGAGAGAAGGGCAAGAAAGCTGCATAGATACGGAATCAGCTCATACGGGCTTCATCTGAAAAATTTTATTTAGGATAGTATTTTGTCTTTTTTTTCCTCCAGAGCTGAGGACTGAACCCAGTGCCTTGCACTTGCTAGGCAAGTGCTCTACCACTGAGCTAAATCCCCAAGCCCTTAGGATAGTAAAATACTATCCCTGTCTTAAAAAAAAAACAAGCCCATTTGGATGTTTCTGTTTTGACATAGAACTGCATTATGTAGCTCAGATTGTCCTGGACATCACAGTGACGTCCTGTGTCAGTCATCCTCATTAGTGCTGGAATTGCAAATATTCTAGCCTCACCATTGAGGGTGTAGGCAGGATTTAGAGTAAGATTCCAGCTTTAAAAAATATGTGTATGTGTATATTTTGTCTATGTGTATGGGTATTTTGTCTGCATGCATGTAGTGCCCTCCGAGTCTACAAGAGGGCAGTGGGTTCCCTGGACCTGGACGTACAGATGGTAGTGAGTCGCTGTGTGGGTGTTGGAATTGAGCCGGTCCCCAGCAAAAACAGCCAGTGCTCTAAACCACTAGGCCATCTGTCCAGCCTGGTAATTCCACCTTTTGAGAAGCTGAGTTAGGAAGTTTGCAAGCTTTAGGCAGCCCACAGTAAACCAAGATGGAGGAGGAGGAGCAGGAGAAGAAGACAACTTGATGACATCTTCATATGCAGAGGATTTTATAGCCTATATTGTTAATTACAGACTCAGTTTCCTTCTGTCTTTCAAGGGAAACATTTATCTCCCTTAAGAAAATGTATTATTGTGTAATCCACCTCAGTACACAGAGCACTGTGGTATGTTTTGATATTTCACTTTTTTTTTTGAGACAGGGTTTCTCTGTGTATCCCTGGCTGTCCTGGAACTCACTTTGTAGACCAGGCTGGCCTCGAACTCAGAAATCTGCCTGCCTCTGCCTCCCGAGTGCTGGGATTAAAGGCATGTGCCACCACGCCCAGCTCAATATTTCCCTTTTTATGGTTGAGGGAACAGCTTTAGAAATTTTGAACAGCCACTAAGTAGGATGGTTGGGTTTTGGTTCCCGTGTGTCTGAATTCACAAGAGAAATCTTTGAGTTATATCATCATGAGGATTTGGATTAGTATTCTTGCATAAGAGTTATGACATTTTAAATACTACTGCAGTTGAAACTACTGTGCCTCTAAATGGTTGAAGTGTTCTGTCTTTGGCATCAAAGACTTTTCCTTCCTTCTTCCCTTTTCTCTCTCTTTCTTTCTGTGGGTGACCGTCTGGTGGTAAGGATGGATATTTTAACAATGTCTACGAGGTTCTTTACAACTGTACAATCAGGATTTCAAACAGTTGGTGATATCACAGATGATATTGGCTGTCATGAATGCTTTTGGCACTTAGCAGTCTCTGATCTTCTCAGTGGTTAGTAGAAGCCAACTCCTGCTGTGAAACAGAAATGTTTCTAGACTTTGCCAGATGTCTGCTGGGGGCAAAATCTCCCATAGCTGAGAACCACTGGTATAGTGATTTTTGTTTTTGTTTTTGTTTTTGAGGGTACAGTCTTTCATGGCAGATAGTGGGAAATGAGGAGGCTGGCCACATTGCATTTGAAGCTGGAAACAGATGAATGCTCACAGTTCAGTTTTTTTATAAGTCTGAATAACTGAAAACTTGTTGCTGACATTGCAGGGCTCTGTTGCCAACAAATTCTATGTTCACAACGACATCTTCAGGTACCAAGATGAGGTCTTCGGTGGCTTTGTCACAGAGCCTCAAGAGGGTAAGTGTGAGTCTGTTTTCATGGTTACTTGTGTGGCATCAGACTGCCTTGAGAGGTCTCTTGTTACACTGTATTTTATGAATCAGCAGTGTGAGGGGTCTACAGGGATTTTATTGTTGGGAAGAGACACCATGACCAAGGCAAGTCTTACAAAGGCAAACATTCATGGGGGGCTGGCTTAGTTTCAGAAGTTCATTCCATTATCATCATGGCAGAAAGTGTGCAGTATGTAGACAGACATGATGCTGAAGAGCCCAGAGTTCAGCATCTAGAATCAGAAGGCATCCTGGAAGAGGCTGATTCTACACTGGTAGAGAGCTTGAACATAGGAGACCTCAGAGCCTGTCTATACAGTGACATTGTTCCTTCAGCAAGGTCATGTCTATTCCAATTAGGCCATACTTTCTAATAGTGCCACTCCCTATGGCCAAGCATTGAAACTGGAGGCTACACCTCTTCAAACCACCACACCTAGTTAATGTGAATGGTTAGTTACTCTTGGGTCAAAAGCAAGCCAGTTAGCATGGCTCAGTGCAGAATACCATGCAGAAGGCCTGATATACCTGTGTTGCACTGAGTGGTGGTGAAAGTATGCCATCTTATTAGGGAGCCCCAGTCTTGTAGAATGGGTAGTGGGAGTACCTGCCTTTGGCTCTCCAGTTTCAATTCTGTTCTCAAGCTTTTTGCTGTTTAAAGTGTAGAAGGTGCCTAGAAGAGAGGGCAGACCAGGGTGCAGCATCAGACCTGTGGGGGAATATAGTCTCTGTGTGTCCTGAGCTCTAAATATATAGACCCGTTAGGTTCAGTCCTTCCTTCTGTAGGCTGACTTCACCCTCCCTACACCCATTGTTTGTCTCTGGGGTATAGACCCAGGGGAGAGCATCCTACCACCCTGATGAGAACCATGTGACCACAGCATGGTAGCAAGGACTGAATTCTCATTGTTCTCTAGCCTCAGTTTACTTGGGGCAT
U3_D5 55306548 55307194 647 CTTTGTAATAAACGGGGCCTCTGCACTCTTCACTCCTGTATACTTGGTTTATTCAGCCAAGGCAAAAGTAAAGCTGCTGAGTGCAGTGCAGAATGACCTCCCCGACTCAGAGCAATTCTGAAGCCTGTGGCAGGCATTTCACTTTCTCTGTTGCTGTGATAAATAAACTTTGGAAAGAATTTTTTTTTTCCCCTCACAGTTTAAGGGGGAATAAAGTATCTTGGGGAGGCATGATGACAGGAAAGATTTAAAGAACCTTTTTTTTTTTTTAAAGATTCAGTGTTCTTAATTAAAATGCTTAATCTTTCCCTTAAAGTCTGCCATGGCTTTACCAGGTTGCCGTGCTTTTAAGTTTGTGACTATAAAGTGATTGTAGTTATTTTACATCTCTTCCTTTCTTAGAATCCGAGGAAGAAGTAGAAGAACCTGAAGAAAGACAGCAGACACCAGAGGTGGTGCCTGATGATTCTGGAACTTTCTATGATCAGACTGTCAGGTAAGGAAACTTCTCTTCACTTGCCCAGGCTCGCAATAAGAATGTGGATTAGCTGGAGACAGACGTGTCTTCTAGGGTTGATTTCAGGAGGTGAGCAGAGTCTGGATCCGTGGAGAGAGATTGGCAAGTATGTGCCAGCTAAGTCAGATGT
D3_G3 55307333 55310964 3632 AACTAGCAATATGCAACTTTTACTTATTTTATAGGAGATACTATGGAAAGTGTTGAATGTGTATGGTTTAGGTTGCTAATTGTTTTGAAGACAGGTGCTCACCATGTAGCTGAGGCTAAGCCTGGAACATCTGTCTGAGTGTTCGAGATGCTGGGATTGTAGGCACGCACACATATATCAGAAGAGTTCATTTAACTAGAGTAATAAAATGTCGAAGCCATAAGCTGAGTAATAATGAATTTATAGTCCAGCCCTGCAGCTCAGAGGAAGCGGCGTGGCATAGGATGACCTGAGTTAGGTTCCTGGAACCCCGTGTTAGAAAGAGAGAATTGACCTTGAGGATCTTTTCTGCCCTCCACGTGTGTGCCGTGAATTTCAGGCTGTCCTGAGGGCTGGAGAGACTGCTCAGCTGTGATAGGCACTGGCTGCTTTTGCAGAAGATTTGAGTTTAGTTCTCACCACTCACATGGTACCTTAGTACTTCTTTAACTCGAGTTGCAGGAATCATGTTTTTGGTGCACTGTATACTCTTAAAAACATGTATACACTTAAAAACATGTAGACATATAAAAATACTATTTTTAAGAGGACAGTTTTGGCCTACATGACAAAAACCCTTGTTTAAAATTTTCTCATGACCTCAAATAATGAGTGTGATGTTGTCTTAGTTTTTTATGTTCCTGATAGGCCACTGAGCCACGATTGTTCCAGATGTCAGTGCTCAGTGTTCAATCAAGTGTTTATCAAGGTGTGGTCAAACCTGTTCATGCTAGGCTGAGAGTGAAGATGTGTTTTACGGAAGACCTACTTACTGAGGTCAGGTATCAGGAGGGAGAACAAGGCCAGGGACAGCGTTCCTTGGCAGCTGGTATGGGAATATAACCACTGTTCTTGGTCATAACTGATGTCTTCTCTTCCAGAACTCCTGGTGCATGGAGTTTGTTAAAGATTGATTTATCTACGTGTTATATGTATGTGGGTGTTCTGTGTGCATGTGCTTCTGCACATCAGAAAAGGGCATTGGATCACATAGGCAGTCAGGACCCCAGAAAGAAAGATCTTAGCCACTAAGCCACTTCTCCAGTCCCCTTGTGTATTTCTATGGGGCTTGTGTGTGGTTAAAGCCACAGATGATGACATTTACTATATTTTGAGACTGACTTGCCTTACTTGGCTTGCTGGGCCTGTGCTAGGCCTCAGAGAGTTTGATCTTTCTCTAGCCCATTCAATACAAGGGTTTTGTGATACATATATTAATAAGCTAATTAACATTAACTGAAAACCACTTGATTCTGTTTTGATCATTATATTTATCAGAATTTAGCCATCAACCTCTTGTCCTGAGACTCTCTGGAGTCATTAGATGGCTCAGAGTATCTGGGTGAGTCCCAGAGACAGGTCAAATTTTCCATTCCATGACAGCAATGACTTGGAGGAGCATTTAGAGGAGCCTGTAGTGGAACCAGAACCGGAGCCAGAGCCGGAGCCGGAGCCGGAACCTGTGTCCGACATTCAAGAGGACAAGCCTGAGGCTGCATTGGAAGAAGCTGCTCCCGACGATGTGCAGAAGAGCACTTCCCCGGCCCCGGCTGATGTGGCCCCGGCACAGGAGGACTTGAGGGTATGGGTTGTGGCTTAGCACTGTATTGCTGTCTTATTACCTGTTTGTTGTTGCTATGCTAAAGGTCAGCCCCAGGTTGTGGGTGGGAGAGTATGTGCCAGGCATGCCCCAGGCTGGCCTCAAACTCCAGACACAGCTGAGGCTGATTTGATTCTCTGGCTCCTATTTCCTATTTGTTGGGATTATATTTCTGTGTTGCCTTGCCTGATTTATAAGGCACTCAGGACTAAGCCCAGGAGTTTGTGCAAAAAAGCTGTTGCTAACTGAGCCATATATTTACTCTCTGCTAGTTTATTTATTTGAGACATGATTTCTCTGTGTAGCCTTGGCTGTTCTGGAACTTGCTCTGTAGGCCAGGCTGGCCTTGAACTCAGAAATCCAGAAATCCACTTACCTCTGCCTTTCAAGTGCTGGGCTTAAAGGCAGCCCCCCCTGCTAGTTTATTTTTAATTTTTTTCTTCGTTATAATTACTTAGTTGACTTTTACGATGATCTAGCTATTTAGCCCAGGCTGGCTTATCTTGGTCCCCTAAGTATCTGGATTATCGGGTGTAATGATAGGCAGGGCTGCTTCTAAGGCAGTTTGTGAGGTGGCAGATGCTTGTAGACTCCTGTCTGTGAGTGATGTAGAGGTGATGCGGAGCAGAAGTTAATGGCTCTTTGTCGCTCTGACATGTCCTGTTCTTCTCTAGACGTTTTCTTGGGCATCTGTGACGAGTAAGAACCTTCCTCCCAGTGGGGCTGTTCCAGTGACGGGGACACCACCTCATGTGGTCAAAGTGCCAGCGTCACAGGTAAGGGTCTGAATCTAGGACTTTGGGCAGATTTAACTATGCTTTGGACACGTGACTTAACAGGCTAAGAGAATGGGAGGGAGCCTGGTACACAGGGAGCAGATAGGAGGTGTTTCCCTGGGGTGTGTTGATTCATTGAGGACGGCAGCGCTGTGGTGAACTGCACAGTAGTAGTTAGAGTAGCACCTGACAGAAAGCAGGGGCTTCCTGATGTGTGTGAAGGTTTCTTTCTATGAGTGTGTGCATGCAGGTATAAGCCAGAGGCCAACTGCTGACAGTTTTCCTTGGGAGCTGTGTACTTTGGTGTGGTTTTTTTTTTTTTTTTGAGACAAGGTCTCTGTTGACCTGGAGCTCTCAGGTTAGGGGAGGTTGGCTGGCCTGTAAAACTTGGCGCTGCCTAGTAGTCTCACCTCCTTGGAGCCAGAATTGCTGTTTTTCTAGGTTCATAGTTTTGTTTAAGAAAATTGACAAGATGTGGGAGAGACAGCTCGGCTGTTAGAAGGAGCATTTACTGCCCTCGCAGAGAGAGGACTGGGTTCAATTTCCCAGTGTCATATGATGGCTTATGACTGTCTGAAACTCCAGTCCTAGGGATCTCATGTCCTCTTCTGCCTTCAGACGATGCATGAGTTTGAGTGCACAGAGACTCATGGATCACATACTTTTTAAACATTTACTCTTTGATTGTATGGTTATGGATATTTGCCTGCAAATTTGTTTGCATCGTGTCTGTCTTCTATCCTTGGAGGCCAGAAAATGGCACTGCAGTTATAGTTGTAAGAAACCAGGTGGGTTCTGGGACTTGAACTTGGATCCTCAGGAAGACCTACCAGTGCTCCTACCCTACACACATTTATTTTAAGTTATATATGTATATTGTTATAAACATATAAGATATGTATATACACACAGATAAACATATATATACATATATACATAAACATATATGTATGTATATATATATATATTTTTAAGTTAAAGTGTGCAGGGAGCATGGTTGGATTAATGTCTCAATGGTTAAGATCTTTCCTGTTCTTGAAGAGGATCTGGGTTTAATTGCCAGCACCGACATGGTGGCTTACAACCATCTATAACTCCAGTTCCAGCAGATCCGATGCCGCCTTCTGGCTTCTTCTGTCAAAACATACAGATGCATGAAAGCAAAACACTTAGACATGTTGGATAAAAAGGGGAAATGAAAAGCCAATGACAGAGCT
U5_15 55291480 55306528 15049 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Comments:
Created
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creating candidate regions
attempting to insert candidate regions into db
done inserting candidate regions
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running aos on gaps
finished running aos
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AOS Produced 14 oligo candidates altogether
inserted results of aos runs
Aligned target to NCBIM37 assembly: chr: chromosome:NCBIM37:11:1:121843856:1, start 55306949: end 55307043
Found 8 RP24 black6 bacs on NCBIM36
Found enough RP24 bacs: not looking for RP23
Entered all non-repetitive oligos
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DESIGN COMPLETE
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Creating display features: mapping to reference assembly
Created display features
Inserted short and long range genomic sequence arms

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